Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms