Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms