Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms