Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms