Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tarbp2P97473 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms