Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Nbr1P97432 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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