Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms