Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmsP97355 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmsP97355 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SmsP97355 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SmsP97355 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmsP97355 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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