Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H3f3aP84244 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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