Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms