Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms