Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms