Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad50P70388 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms