Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Msx3P70354 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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