Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54lP70270 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54lP70270 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms