Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms