Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms