Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2bP67871 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2bP67871 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms