Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms