Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms