Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms