Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn4P57780 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn4P57780 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn4P57780 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn4P57780 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms