Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms