Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TdgP56581 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TdgP56581 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms