Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms