Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GferP56213 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GferP56213 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GferP56213 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GferP56213 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GferP56213 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GferP56213 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms