Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc12a1P55014 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a1P55014 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms