Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms