Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms