Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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