Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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