Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr5P51682 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms