Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms