Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms