Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psen1P49769 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psen1P49769 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psen1P49769 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psen1P49769 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psen1P49769 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psen1P49769 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psen1P49769 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psen1P49769 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms