Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms