Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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