Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms