Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx1-2P42580 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms