Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VhlP40338 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VhlP40338 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VhlP40338 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms