Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf1P39428 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf1P39428 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms