Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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