Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms