Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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