Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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