Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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