Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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