Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RxraP28700 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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