Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lef1P27782 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lef1P27782 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lef1P27782 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms