Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RdxP26043 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RdxP26043 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RdxP26043 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RdxP26043 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RdxP26043 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms